В выездных школах развития «Пифагор» участвуют школьники, перешедшие в 2–11 класс, в нынешнем году их 276. Школа включает в себя учебные курсы по самым разным предметам, от математики и физики до истории и философии.
Учебная жизнь школы основана на принципе академической свободы. Учебная программа разрабатывается преподавателями в открытом обсуждении, и преподаватели сами решают, какие занятия они будут вести, а школьники — какие курсы они будут посещать. Курсы рассчитаны на разный возраст, круг интересов и уровень подготовки. В школе широко распространены активные формы учёбы: практикумы по решению задач, учебно-исследовательские семинары - «погружения».
Программа для младших участников проходит в форме исследовательских проектов, учебных курсов и развивающих игр. Учебная и внеучебная программа для младших школьников направлена на развитие умения договариваться между собой и соблюдать правила, поддерживать порядок не только в вещах, но и в отношениях друг с другом, двигаться и слушать свое тело, правильно говорить о том, что думаешь и понимать то, о чем говоришь, наблюдать за миром вокруг и задавать вопросы.
Учебные занятия у старших школьников распределены по сессиям. На каждой сессии участник школы может записаться на два учебных курса либо на одно учебно-исследовательское погружение. Курсы проходят в дообеденное время, по два урока на каждый курс. Погружение занимает всё время между завтраком и обедом; кроме того, во второй половине дня участники погружения выполняют достаточно большой объём самостоятельной исследовательской работы.
В выходные дни участники школы могут участвовать в больших творческих проектах, испытать себя в спортивной олимпиаде, в суточном математическом бое и в других традиционных пифагорейских занятиях.
Послеобеденное время отведено для отдыха и спорта, для купания и работы разнообразных клубов. По вечерам проходят общешкольные конкурсы, интеллектуальные игры, литературные и музыкальные вечера, дискотеки, отрядные огоньки с песнями под гитару у костра.
В последний день школы запланирован Ломоносовский турнир и закрытие.